Mit einem Stäbchen wird in einer Petrischale eine Kultur aufgebracht

Bakteriologie, Mykologie, NGS & GVO

In diesem Laborbereich findet eine Untersuchung auf Bakterien und Pilze als Krankheitserreger statt.

Schwerpunkte unserer Arbeit sind:

  • Bakterien und Pilze als Krankheitserreger von Tieren
  • Untersuchungen auf Tierseuchenerreger
  • Untersuchungen auf von Tieren auf den Menschen übertragbare Krankheiten (Zoonoseerreger)
  • Aerobe, mikroaerophile und anaerobe Untersuchung von Pharmaka und Medizinprodukten (Chargen- und Sterilkontrollen)
  • Untersuchung von Viertelgemelksproben im Rahmen der Eutergesundheit (Mastitisprophylaxe u. -therapie)
  • Durchführung von Resistenztests zur Abgabe von Therapieempfehlungen (Antibiogramme)
  • Untersuchungen für Gesundheitszeugnisse oder Unverdächtigkeitsbescheinigungen (z. B Reisetauglichkeit bei Tauben, Zuchttauglichkeit für Hengste, Stuten, Zuchteber und –bullen, Paratuberkulose)
  • Ganzgenom-Sequenzierung mittels moderner Sequenzierverfahren (NGS) von bakteriellen Erregern aus amtlichen Lebensmittel- und Umfeldproben im Rahmen der Lebensmittelüberwachung und Ausbruchsaufklärung.
  • Laborexperimentelle Überprüfung von gentechnisch-veränderten Organismen (GVO) der Sicherheitsstufe 1 und 2 im Auftrag der Überwachungsbehörde.

Hinweis

Die Herstellung bestandsspezifischer Vakzine wurde vorübergehend eingestellt.

Welche bakteriellen Krankheitserreger werden untersucht?

Der Schwerpunkt unserer Untersuchungen liegt auf dem Nachweis medizinisch bedeutsamer Bakterien, die bei Haus- und Nutztieren, bei Wild-und Zootieren sowie beim Menschen Erkrankungen bzw. krankhafte Veränderungen hervorrufen können.

Als Beispiele sind hier Salmonellen, Yersinien, Campylobacter, MRSA und krankmachende Clostridien zu nennen. Gelegentlich dienen die Untersuchungen auch dem Nachweis des Freiseins von bakteriellen Krankheitserregern, z.B. bei Futtermittel-, Export- und Sterilitätsuntersuchungen sowie im Rahmen von spezifischen Bekämpfungsprogrammen.

Bakteriologische Nachweismethoden

Bakterielle Krankheitserreger werden im Labor auf festen oder flüssigen Nährmedien kultiviert und anschließend anhand ihrer morphologischen und biochemischen Eigenschaften identifiziert. Besonders wichtig sind dabei speziesspezifische Merkmale wie Farbumschläge in biochemischen Tests („Bunte Reihen“). Die Tiefe der Identifizierung richtet sich nach der Bedeutung des Erregers – etwa werden Salmonellen anhand ihrer Oberflächenantigene bis zur Serovarebene bestimmt. Bei Lebensmittelisolaten hingegen erfolgt sogar die Sequenzierung mittels Ganzgenomsequenzierung. Durch anschließende cgMLST-Analyse kann ein Abgleich bis auf Basenebene des Erbguts erfolgen und ggfs. ein Zusammenhang mit einem humanen Isolat nachgewiesen werden.

1. Spezifische Färbungen

Bestimmte Erreger wie Mykobakterien (z. B. Tuberkulose) lassen sich durch spezielle Färbemethoden direkt im Mikroskop nachweisen.

2. In-vitro-Resistenzprüfung

Bakterielle Erreger reagieren unterschiedlich auf Antibiotika. Nach ihrem Anzüchten werden sie auf Empfindlichkeit getestet, indem sie mit Wirkstoffen in Kontakt gebracht werden. Wächst der Keim weiter, ist er resistent; wird er gehemmt, gilt er als sensibel.

3. Hemmstofftest

Beim Hemmstofftest wird mit einem bekannten Keim (z.B. Bacillus subtilis) auf einem definierten Medium geprüft, ob das untersuchte Material Substanzen enthält, die das Bakterienwachstum hemmen.

4. Molekularbiologische Verfahren

Heute werden routinemäßig molekularbiologische Verfahren eingesetzt, die gezielt Erbsubstanz oder Biomoleküle analysieren, z. B.:

  • Polymerasekettenreaktion (PCR) zur Detektion von Virulenzgenen (z. B. bei E. coli) oder Toxintypen (z. B. Clostridium perfringens) oder definierten Sequenzen (z. B. Insert eines GVO).
  • Molekularbiologische Tests für schwer kultivierbare Erreger wie Mykoplasmen, Lawsonia, Leptospiren, Brachyspira, Mykobakterien, Amphibienpilze.
  • 16S rRNS- bzw. 5.8S/ITS-Genomsequenzierung zur Artbestimmung bei Bakterien und Pilzen.
  • Ganzgenomsequenzierung zur Verwandtschaftsbestimmung von bakteriellen Isolaten.

5. Nachweis von Biomolekülen zur Speziesdiagnostik

  • MALDI-TOF-Massenspektroskopie
  • Ganzgenomsequenzierung zur exakten Speziesdiagnostik

Untersuchung von Milchproben

Neben Viertel- und Hälftenanfangsgemelkproben untersuchen wir in unserem Milchlabor viele weitere Probenarten bzw. bieten folgende Leistungen an:

  • Rohmilchproben (aus Vorzugsmilch- oder Direktvermarkterbetrieben)
  • Tupferproben von Melkzeug, z. B. aus Betrieben mit automatischem Melksystem
  • Eutertuch- oder Einstreuproben zum Nachweis von Mastitiserregern
  • Untersuchung von Milchproben von Rind, Schaf und Ziege zum Nachweis von Hemmstoffen in der Milch
  • Quantitative Untersuchungen aus Milchproben zur Bestimmung der Gesamtkeimzahl, Anzahl an Enterobacteriaceae, Escherichia coli, Koagulase-positive Staphylokokken
  • Gezielte Untersuchung auf Mykoplasmen mittels kultureller Anzucht oder PCR
  • Durchführung von Antibiotikaempfindlichkeitsprüfungen von Mastitiserregern

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